而叛军们自然也知道要北上夔州府以及拿下整个重庆府，那就势必要与石柱宣慰使司以及酉阳宣慰使司两地接触，再加上这两地土司兵作战都比较彪悍，因此为了能够有效抗击朝廷，其叛将：樊龙，就派遣使者携带着金银和丝绸，前来与石柱宣慰使司结盟。
顺便在借道北上或者南下酉阳宣慰使司。
然而当重庆卫失陷以及叛贼使者前来招降的消息传来时，明定国将军兼诰命夫人：秦良玉，立刻就把叛贼使者给斩杀了。
还让长子明石柱宣慰使：马祥麟，立即发兵率领叔叔明辽东都司佥书：秦民屏，及大伯明四川都指挥使佥事：秦邦屏，的长子明忠州游击将军：秦翼明、次子明重庆卫副千户：秦拱明、明重庆卫都司：胡明臣、明黔江守御千户：秦永成，等将领统率6千人先行逆流西下。
以明辽东都司佥书：秦民屏，为提调，明忠州总兵：杨学礼，负责督阵，前锋沿江而上，吓得叛军们不敢出。
在乘敌不备之际，直达南坪关，打算断贼归路，毕竟前去出征遵义军民府的叛军还没班师，因此很快叛军就派出部将迎战了，由叛贼：张彤，迎战明军，却被明石柱宣慰使直接斩杀。
另一边明定国将军兼诰命夫人正设伏，打算袭击两河北上夔州府的叛军，并将敌人的船只全部烧毁。
随后就派兵守住重庆府忠州，禁止叛军北上，又派快马携带檄文前去夔州府，要求当地驻军赶紧防守瞿塘卫山峡上下游地段，以击退来犯入侵的贼兵。
同时明定国将军兼诰命夫人：秦良玉，还上表了，弟弟明辽东都司佥书：秦民屏，等人的战功，结果朝廷决定封明辽东都司佥书为〈四川总镇左参将〉明忠州游击将军：秦翼明、明重庆卫副千户：秦拱明，分别为［四川总镇守备、重庆卫守备］。
9月20日，由于「镇江大捷」大大的提高了明军士气，极大地鼓舞了全国军民人心，朝廷因此对明定辽右卫左参将：毛文龙，破格提拔，升为〈定辽右卫副总兵〉。
明内阁首辅：叶向高，还把明定辽右卫副总兵：毛文龙，比作是历史上的孤胆英雄如；东汉西域都护兼定远侯：班超、东汉长水校尉：耿龚，并称赞道“毛参将收复镇江堡，人情踊跃，而或恐其寡弱难支，轻举取败，此亦老长考虑。但用兵之道，贵在出奇，昔日班都护以三十六人而定西域，耿校尉以百人守疏勒国，皆乃奇功也……今幸有毛参将，此举稍得兵家用奇用寡之法。”
就连明太常寺少卿兼国子监司业：董其昌，都评价说“毛副总兵以二百人夺镇江堡，擒逆贼，献于阙下，不费国家一把铁、一束草、一斗粮，立此奇功，真乃奇侠绝伦，可以寄边事者！如此胆略，夫岂易得？使今有三文龙，奴可掳，辽可复，叛贼李永芳、佟养性可坐缚而衅之鼓下矣。”
正当大明朝廷献俘叛贼佟养真，于紫禁城内被明熹宗天启帝：朱由校，下令斩首之后，朝野上下还都沉浸在镇江大捷的喜悦当中，丝毫没有把东虏建奴放在眼里。
因此后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，在处理完漠南蒙古内喀尔喀五部联盟事情，以及物资之后，便开始对明军镇江大捷展开了报复性的行动。
趁着明定辽右卫副总兵：毛文龙，在镇江堡立足未稳，便派后金二贝勒：爱新觉罗·阿敏、后金四贝勒：爱新觉罗·红歹是（皇太极）率领三万后金八旗军前去镇压。
如今毛家军收复了镇江堡，东连李氏朝鲜王国，西连辽南四卫，南接登莱两府、天津三卫，所以东虏建奴东要防他与李氏朝鲜王国合兵捣巢，南要防他与辽南四卫、登莱两府、天津三卫，合兵恢复辽阳卫。
若此时后金军进犯广宁卫，又怕被毛家军合兵断河，截他归路，或轻兵袭他粮库，剿他后队，有一个不两立之势。
况且后金二等总兵：佟养性，又因他拿了自己兄弟后金定辽右卫游击将军：佟养真，急着要报仇，就撺哄奴酋先稳住辽南四卫，断了毛家军陆路回广宁卫，后又装载炮车，直取镇江堡。
后金覆育英明天命汗更是下令，让后金三贝勒：爱新觉罗·莽古尔泰，协同后金大贝勒：爱新觉罗·代善，将金州卫、金州中左守御千户所，等地城堡的居民全部迁徙到了复州卫。
又将其余所有沿海地区的汉族百姓全部迁移到内陆地区，乃至定辽右卫派兵把守，一时间辽东都指挥使司沿海地区的百姓们，都是哭声震天、哀嚎遍野。
为了稳住辽南四卫，就让后金复州卫总兵：刘爱塔（刘兴祚）、二弟后金复州卫副总兵：刘兴治、三弟后金复州卫左参将：刘兴沛、四弟后金复州卫右参将：刘兴基、五弟后金复州卫千户：刘兴贤，这五兄弟负责稳定局面。
其中大哥后金复州卫总兵：刘爱塔，乃是后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，的侄女婿因此对他比较放心。
而后金复州卫总兵也比较卖力，毕竟辽南四卫大明汉人军民甚多，刚刚迁居到此的后金八旗子弟们又与大明汉人军民关系不合，因（剃发易服令）还镇压过一批人。