消息很快就引得明黔国公兼太子太保：沐昌祚，明云南巡抚兼都察院右佥都御史：萧彦，一起督兵夹击斩杀八十四人，俘获六百八十人，叛军不得已诈降，败逃云南府安宁州、武定军民府、姚安军民总管府。
4月初7日广东承宣布政使司南雄府始兴县僧人：李圆朗，在朔源村下洞水宝庆庵内造妖书，煽动人心，言有易死还生，先天演禽及剪纸为人马之术。
夜间则飞动并飞劫杀人诸秘法，诡称韶州府翁源县人：王子龙，为齐冲天将军兼金统帝：黄巢，之后，有金统帝遗产十二窑，愿从者可瓜分之。
又称王子龙乃弥勒降生，子丑年天有大灾，鬼将食人，捐资自投者给米符可免。
就这样经过一番舆论准备之后，妖僧：李圆朗，就与王子龙聚集南雄府始兴县、韶州府翁源县两地白莲教徒数百人，开始发动武装造反，并分兵到处杀害富商祭旗鸣金，又出兵攻打南雄府附近县城，声势甚大。
受到了广东承宣布政使司南雄府官员重视，集结好乡兵进行镇压，王子龙被抓斩首，妖僧李圆朗则在4月初9日被，明督察院右都御史兼南赣巡抚：秦耀，俘虏五马分尸。
4月20日，明兵部尚书：赵焕，根据明都察院左佥都御史兼福建巡抚：周寀，的建议以漳州府沿海居民贩海通倭寇为由，规定东、西二洋，各派船只四十四艘，不得超过限额。
6月初6日，北直隶河间府沧州、静海县、吴桥县，一带运河地区刮起大风，漕船互击淹溺二十三人，失去漕米三千一百五十七石。
同时明云南巡抚：萧彦，调集云南都指挥使司的滇军以及土司兵，对叛军进行围剿，于6月11日彻底平定，明楚雄府副总兵也因此被调去广西承宣布政使司。
9月17日明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤，在解决了建州女真栋鄂部问题之后，因有栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，前来率部投降，再加上建州女真苏完部首领：瓜尔佳·索尔果、建州女真雅尔古部首领：佟佳·扈尔汉，均率部来降使得建州左卫军民指挥使司兵力大增。
当即决定厚待来投诸部女真首领，对苏完部首领：瓜尔佳·索尔果，长子：瓜尔佳·费英东，授封为「一等大臣」在把台吉：爱新觉罗·褚英，长女：爱新觉罗·东果，许配给栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，在收雅尔古部首领：佟佳·扈尔汉，为养子赐姓〈觉罗〉。
并在孙女婿栋鄂部首领：栋鄂·何和礼，的挑拨离间之下让明建州左卫军民指挥使借着回师之际，趁机攻打王甲城灭了建州女真完颜部，以报自己灭族之仇。
就这样建州左卫军民指挥使司开始转而回师，进去了王甲城地区，建州女真完颜部首领：完颜·荪扎秦光衮，得知好友归来，自然是毫不犹豫地下令开门迎接。
因此建州左卫军民指挥使司军队进城之后，随之而来的便是气势汹汹地栋鄂女真部军队，慌乱之时建州女真完颜部首领连忙布置城防，以及下令关闭城门。
还祈求建州左卫军民指挥使帮助他对抗外敌，谁知明建州左卫军民指挥使却要他投降献城归顺。
眼看城下栋鄂女真部军队攻城很急，由不得他考虑太多！情急之下建州女真完颜部首领便答应了要求。
这下明建州左卫军民指挥使才在城楼上面示意停止攻城，仅仅只是捆绑了完颜·戴度墨尔根，作为双方各退一步的筹码斩杀。
此时建州女真三卫的八个部落，还有鸭绿江流域的朱舍里部、纳殷部，尚未攻克。
10月初9日，明孟养军民宣慰使：思威，死去后，朝廷任命他的长子：思远，为孟养军民宣慰使。
次日缅军得知消息便进军孟养军民宣慰使司，攻破孟拱城，明孟养军民宣慰使：思远，连忙带领族人逃入盏达付宣抚使司。
11月18日缅军又攻破孟密宣抚使司管辖的孟广城，明孟密宣抚使：罕洪，被迫逃入陇川宣抚使司，又被缅军追击进攻陇川宣抚使司，好在及时被明军击退。
12月21日，明大理寺左评事：雒于仁，上奏道“臣入京以一年有余，只有三次见到陛下，此外惟听说陛下身体欠安！拜天地祭祖宗，往往遣官代往，政事不亲理，圣学久停不讲，臣由是知陛下之病，药物难攻，只有臣的四箴可治，陛下之病在酒、色、财、气，臣闻嗜酒则腐肠，恋色则伐性，贪财则丧志，尚气则戕生，陛下白天美酒佳肴仍嫌不足，继以长夜作饮，此其病在嗜酒，宠十小阉，溺爱郑皇贵妃，言听计从，斥逐忠谋，不立东宫，此其病在恋色，不断征索库银，括取币泉，以至拷讯宦官，献上金银珠宝则已，否则便发怒切责，此其病在贪财，喜怒无常，今日打宫女，明日鞭挞阉人，罪状未明，立死杖下，积怨怒于直臣，一屈不申，赐死无日，此其病在尚气，四病绞绕身心，岂药石所可治，今陛下春秋鼎盛，犹长期不视朝，今后更当何如？陛下有此四病，不说是操生杀之权，人畏之而不敢言；则说是身居深宫九重之地，人莫知而不能言。保禄贪生之士，害怕威权；怀忠守义之人，何避釜锯！臣今日特撰四箴，劝陛下戒嗜酒，戒恋色，戒贪财，戒尚气，若陛下肯用臣言，即使立诛臣身，臣虽死犹生。”
这份奏折呈上去之后，明神宗看后非但不思己过戒除四病，反而大为震怒，罢雒于仁为庶民。